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何時該選擇高保真聚合酶？

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  產(chǎn)品名稱   貨號 規(guī)格 價格
Pfu DNA聚合酶
 CLS-1021
 250u 150.00
Pfu DNA聚合酶（含dntp）
 CLS-1022
 250u
 190.00
Pfu DNA聚合酶
 CLS-1023
 1000u 560.00
Pfu DNA聚合酶（含dntp）
 CLS-1024
 1000u 640.00

    在PCR實驗中使用適當(dāng)?shù)木酆厦笇⒋_保*佳的產(chǎn)量和特異性，但市場上有那么多種聚合酶，如何選擇，有時還真是個難題。廠家一般都會提供一個選擇指南，列出每個產(chǎn)品的特異性、保真度、產(chǎn)量等。保真度是實驗成功*關(guān)鍵的因素之一，不可不重視。
什么是聚合酶保真度？
    DNA聚合酶的保真度是指準(zhǔn)確復(fù)制目的模板的結(jié)果。具體來說，這涉及到多個步驟，包括讀取模板鏈，選擇正確的三磷酸核苷，并將此核苷酸插入3’引物末端的能力。為了高效區(qū)分正確和錯誤的核苷酸，一些DNA聚合酶具有3’到5’核酸外切酶活性。這種“校正”活性可切除不正確摻入的單核苷酸，并將其替換成正確的核苷酸。高保真PCR使用摻入錯誤率低且具有校正活性的DNA聚合酶，以保證目的DNA的忠實復(fù)制。
保真度在何時很重要？
    在設(shè)計PCR實驗時，你首先要考慮你的應(yīng)用是否需要高保真聚合酶。如果實驗結(jié)果依賴于正確的DNA序列（如克隆或測序），那么你就要盡量減少錯配核苷酸的摻入。而對于普通PCR或菌落PCR，確定擴(kuò)增子是否存在或質(zhì)粒上是否帶有插入片段，那高保真則大可不必。由于某些高保真聚合酶的強(qiáng)勁特性，一些研究人員在所有擴(kuò)增中都使用它們。
如何測定保真度？
    廠家通過各種不同的方法來確定DNA聚合酶的保真度。Thomas Kunkel曾介紹過一種方法，使用M13噬菌體的部分lacZα基因，通過宿主菌落顏色的變化來檢查DNA合成中的錯誤。以Kunkel的分析為基礎(chǔ)，Wayne Barnes則開發(fā)出一種分析，利用PCR來復(fù)制整個lacZ基因和兩個抗藥性基因的一部分，隨后連接、克隆、轉(zhuǎn)化和藍(lán)白斑篩選。若lacZ基因存在錯誤，則破壞β-半乳糖苷酶活性，導(dǎo)致白斑的出現(xiàn)。通過這些實驗方法，白斑克隆的比例可轉(zhuǎn)化為錯誤摻入的數(shù)量。Sanger測序則提供了保真度的更直接讀取，可檢測所有突變。利用這種方法可確定聚合酶的整個突變譜。
何為高保真？
    關(guān)于DNA聚合酶的高保真，目前還沒有統(tǒng)一的定義。人們往往與Taq DNA聚合酶比較，來判斷保真度的相對高低。例如，NEB（New England Biolabs）的科學(xué)家測定Taq聚合酶的錯誤率為2.7x10-4 ± 0.8x10-4，或每3700個堿基1個錯誤。這些數(shù)據(jù)表明，利用Taq以25個PCR循環(huán)擴(kuò)增400 bp的片段，可能一半的克隆都帶有錯誤。對于較大的片段如1 kb，每個克隆都可能帶有不想要的突變。相比之下，NEB的Q5超保真聚合酶的錯誤率比Taq低100倍。根據(jù)這一數(shù)據(jù)，200個克隆中的199個將是正確的。 
    通過以上介紹，相信你對保真度這個概念有了一定的了解。

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