Western Blot已經(jīng)成為實(shí)驗(yàn)室中檢測(cè)蛋白質(zhì)的常規(guī)手段。不過想要得到一張條帶清晰、沒有雜帶、背景干凈的圖片,還是具有一定挑戰(zhàn)性的。我們?cè)谧龅鞍纂娪竞蚖estern Blot時(shí),多數(shù)都用的Bio-Rad公司的儀器和abcam公司抗體,所以Bio-Rad蛋白方面的技術(shù)專家的確可以稱之為專家,因?yàn)槊刻於加泻芏嗳讼蛩麄冋?qǐng)教。他們就將*常見的問題整理成《Western Blotting Troubleshooter》。我們節(jié)選了一部分,希望能幫你節(jié)省一些查資料的時(shí)間。
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品牌 抗體名稱 貨號(hào) 規(guī)格 市場(chǎng)價(jià) 促銷價(jià) Abcam Anti-Chk2 (phospho T387) ab55319 100 μg 3996.00 3196.00 Abcam Anti-Chk1 [EPR3952] ab133277 100 μl 4175.00 3340.00 Abcam Anti-CDKN2A ab189034 50 μg 3996.00 3196.00 Abcam Anti-ATR抗體[2B5] ab4471 100 μg 4255.00 3404.00 Q:我的結(jié)果是膜上一片空白。為什么會(huì)這樣?
A:導(dǎo)致這種結(jié)果的因素很多。 膠和膜放反了 如果在轉(zhuǎn)印的過程中,膠和膜的位置顛倒了,那么蛋白就從膠上轉(zhuǎn)移到緩沖液中,而不會(huì)到達(dá)膜上。對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)的轉(zhuǎn)印,凝膠應(yīng)靠近三明治的負(fù)極,而膜對(duì)應(yīng)正極。 轉(zhuǎn)膜效率低 轉(zhuǎn)膜效率受多種因素影響,包括蛋白的大小、凝膠中丙烯酰胺的百分比、電場(chǎng)強(qiáng)度、轉(zhuǎn)印時(shí)間和緩沖液的pH值。一般說來,蛋白越大,轉(zhuǎn)移得越慢。轉(zhuǎn)移大蛋白*好的方法是用高的電場(chǎng)強(qiáng)度。而小蛋白長(zhǎng)時(shí)間處于高電場(chǎng)強(qiáng)度下可能會(huì)穿出轉(zhuǎn)印膜。避免這個(gè)問題的方法是用0.2 um孔徑的NC膜或PVDF膜進(jìn)行轉(zhuǎn)印。如果蛋白的等電點(diǎn)接近緩沖液的pH值,那么這個(gè)蛋白攜帶的電荷很少,在電場(chǎng)中也幾乎不移動(dòng)。如果你的目的蛋白是強(qiáng)堿性的,那么你可以用碳酸鹽(pH9.9)、CAPS(pH11)及酸性緩沖液。 在轉(zhuǎn)印之后,你可以通過染膠或**塊膜來判斷轉(zhuǎn)印效率。為了幫助你直接監(jiān)控轉(zhuǎn)印效率,Bio-Rad也提供了多種預(yù)染Marker,它們?cè)陔娪疽约稗D(zhuǎn)膜之后可直接觀察到。試劑放置太久或存放條件不正確 抗體會(huì)慢慢降解,如果反復(fù)凍融的話,它會(huì)快速降解。底物應(yīng)儲(chǔ)存在-20°C。 抗體不純或滴度太低 一抗的濃度差異很大,應(yīng)該根據(jù)經(jīng)驗(yàn)來決定一抗的稀釋度。過猶不及,太多的抗體也會(huì)阻礙抗原與抗體的結(jié)合。一般的原則是以1:100-1:1000來稀釋血清或組織培養(yǎng)上清,以1:1000-1:10000來稀釋腹水或超**動(dòng)物的血清。Bio-Rad的印跡級(jí)別的二抗稀釋度是1:3000。 酶失活了 疊氮鈉是辣根過氧化物酶的抑制劑。不要在HRP顯色的western blot中使用任何含疊氮鈉的試劑。疊氮鈉可以用于堿性磷酸酶結(jié)合的抗體中,而無副作用。另外,自來水或用聚苯乙烯樹脂去離子的水也可能會(huì)使酶失活,只能使用蒸餾的去離子水。 使用Tween-20洗滌 Tween-20(吐溫-20)可能會(huì)干擾某些抗體-抗體相互作用,或洗走NC膜上的目的蛋白。盡管在洗滌時(shí)它的終濃度只有0.05%-0.1%,但仍可能會(huì)影響結(jié)合。因此除了封閉之后的**次洗滌,其他洗滌過程中都不使用Tween-20,不過,這可能會(huì)使背景升高。 檢測(cè)系統(tǒng)缺乏足夠的靈敏度 確保蛋白的上樣量在檢測(cè)系統(tǒng)的靈敏度范圍內(nèi): 辣根過氧化物酶 500 pg/band 堿性磷酸酶 100 pg/band 增強(qiáng)的堿性磷酸酶 5 pg/band 膠體金 100 pg/band 增強(qiáng)的膠體金 10 pg/band Immun-Star 化學(xué)發(fā)光 10 pg/band Q:我的western blot總是背景過高,如何解決?
A:背景過高可能是由很多因素引起的:封閉不完全、顯色過度、洗滌不充分、轉(zhuǎn)移緩沖液或設(shè)備有污染、抗體稀釋度不對(duì)或抗體不純。
封閉不完全 一抗或二抗只要結(jié)合到膜上,就會(huì)顯色。為了避免非特異性的結(jié)合,應(yīng)用封閉液孵育膜,使所有的空白位點(diǎn)都被封閉蛋白占有。NC膜推薦的封閉液是3%的明膠。在室溫孵育1小時(shí)。明膠不能在4℃孵育,因?yàn)樗鼤?huì)凝結(jié)。如果想要低溫封閉的話,可以用3%的BSA。PVDF膜推薦的封閉液是5%的脫脂奶粉。脫脂奶粉不能與Bio-Rad生物素化的蛋白標(biāo)準(zhǔn)一起使用。脫脂奶粉濃度過高也可能會(huì)產(chǎn)生背景。生物通 www.ebiotrade.com
二抗不純 沒有交叉吸附過的二抗可能會(huì)與膜上的其他蛋白相互作用,產(chǎn)生雜帶。
功率條件 轉(zhuǎn)印過程中產(chǎn)生的熱是與功率成正比的。我們都知道,功率是電壓與電流的乘積。P="IE" 而電壓、電流和電阻又滿足這個(gè)等式:R="V/I。當(dāng)緩沖液分解時(shí),電阻下降。如果電壓是恒定的,則電流上升。因此,功率上升,產(chǎn)生更多的熱量。如果電流是恒定的,則電壓和功率下降,使蛋白轉(zhuǎn)移得更慢。
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