新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的暴發(fā)已經(jīng)在全球范圍內(nèi)引發(fā)了嚴重的公共衛(wèi)生危機。SARS-CoV-2是導致COVID-19的主要病原體,它是繼SARS-CoV和MERS-CoV之后第三種對人類具有高致病性的冠狀病毒[1]。研究表明,ACE2(血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2)是介導SARS-CoV-2入胞的高親和力受體,SARS-CoV-2通過其表面刺突蛋白(Spike,S)的受體結(jié)合域(RBD)與ACE2互作而感染細胞。然而,ACE2在****中的表達分布與SARS-CoV-2的器官嗜性并不完全相關(guān)。比如,在整個呼吸道、大腦以及多種**細胞中,ACE2的表達較低或幾乎不表達,但是這些細胞仍然可以被SARS-CoV-2感染。因此,可能存在ACE2以外的受體來介導病毒進入宿主細胞。
目前,已有多項研究發(fā)現(xiàn)與SARS-CoV-2感染相關(guān)的關(guān)鍵宿主因子,比如基于CRISPR基因敲除系統(tǒng)的高通量功能性篩選。然而,這些篩選均沒有發(fā)現(xiàn)ACE2以外的新受體,這可能是因為此類基于功能缺失的篩選是在ACE2的表達和功能占主導地位的細胞類型中進行的[2-5]。
北京大學魏文勝課題組、中國醫(yī)學科學院/北京協(xié)和醫(yī)學院王健偉課題組與北京大學肖俊宇課題組在 Science China Life Sciences 雜志聯(lián)合發(fā)表了題為“Genome-wide CRISPR activation screen identifies candidate receptors for SARS-CoV-2 entry”的研究論文,該研究通過基于CRISPR激活(CRISPR activation, CRISPRa)系統(tǒng)的全基因組水平的功能獲得性篩選,發(fā)現(xiàn)了多個介導SARS-CoV-2入侵細胞的潛在新受體。
為了系統(tǒng)性研究SARS-CoV-2入胞的關(guān)鍵因子,該研究使用SARS-CoV-2假病毒在HEK293T細胞中進行了全基因組CRISPRa篩選。該篩選基于實驗室之前建立的內(nèi)置分子條形碼(iBAR)方法[6]在sgRNA中添加外置條形碼(eBAR),建立sgRNAeBAR文庫,從而可以使用高感染復數(shù)及較少的細胞量進行高質(zhì)量文庫構(gòu)建。篩選結(jié)果表明,除了發(fā)現(xiàn)已知的SARS-CoV-2受體ACE2、主要宿主細胞蛋白酶TMPRSS2以及已報道的ACE2依賴性共受體NRP1外,還鑒定出多種新型宿主因子可能參與SARS-CoV-2入胞機制中(圖1)。
結(jié)合SARS-CoV-2假病毒和真病毒實驗,該研究發(fā)現(xiàn)膜蛋白LDLRAD3、TMEM30A和CLEC4G能夠以不依賴于ACE2的方式有效介導病毒入侵細胞。此外,研究證實這些膜蛋白都能夠與SARS-CoV-2 S蛋白結(jié)合。與ACE2結(jié)合S蛋白的RBD不同,這些蛋白能夠特異性結(jié)合S蛋白的N末端結(jié)構(gòu)域(NTD)(圖2)。LDLRAD3在神經(jīng)元中高度表達,*近作為委內(nèi)瑞拉馬腦炎病毒(VEEV)的關(guān)鍵受體受到關(guān)注。實驗表明,敲低LDLRAD3或在細胞上清中加入其可溶性蛋白可顯著降低SARS-CoV-2對神經(jīng)元細胞的感染。CLEC4G在肝臟、**結(jié)和單核細胞中高度表達,已知其作為細胞粘附因子促進SARS-CoV感染宿主;通過在肝臟細胞中進行敲低實驗證實了CLEC4G在SARS-CoV-2入侵細胞中的重要作用??缒さ鞍譚MEM30A在*近的SARS-CoV-2全基因組敲除篩選(Huh7.5細胞)中也被鑒定出來[4],研究進一步證實了其對于SARS-CoV-2入胞的重要性以及其與S蛋白的直接結(jié)合。這些具有組織特異性或廣譜表達的新受體的發(fā)現(xiàn),有助于進一步揭示SARS-CoV-2的多器官嗜性,并為探究COVID-19的新**靶點提供線索。(生物谷Bioon.com)