在人類(lèi)細(xì)胞中,總長(zhǎng)約2米的基因組DNA通過(guò)與組蛋白纏繞形成核小體,并經(jīng)過(guò)螺旋折疊等方式盤(pán)繞形成染色體進(jìn)而團(tuán)聚于直徑10微米的細(xì)胞核中。在細(xì)胞內(nèi)的DNA需要進(jìn)行轉(zhuǎn)錄等活動(dòng)的時(shí)候,DNA才會(huì)從組蛋白中釋放出來(lái),裸露出需要與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的位點(diǎn)從而便于轉(zhuǎn)錄,染色質(zhì)的這種特性叫做染色質(zhì)可及性,暴露的區(qū)域被稱(chēng)為“開(kāi)放染色質(zhì)”。作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控的核心區(qū)域,順式作用元件附近的染色質(zhì)通常具有較高的可及性,利用全基因組染色質(zhì)可及性檢測(cè)技術(shù)可鑒定出潛在的順式作用元件。
近日,發(fā)表在《Cell》上的一項(xiàng)題為“A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome”的研究中,來(lái)自美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校的研究團(tuán)隊(duì)利用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)在30個(gè)人類(lèi)組織中分析了約60萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,并通過(guò)與之前數(shù)據(jù)的集成分析識(shí)別了222個(gè)細(xì)胞亞型并注釋了近120萬(wàn)個(gè)順式作用元件,繪制了目前*大規(guī)模的人類(lèi)單細(xì)胞染色質(zhì)可及性圖譜,為解析基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制以及人類(lèi)復(fù)雜**的致病機(jī)理提供了寶貴的參考資源。
該研究對(duì)人類(lèi)發(fā)育的不同階段進(jìn)行了較為**的組織分析,同時(shí)也為尋找具有細(xì)胞類(lèi)型特異性的致病基因提供了數(shù)據(jù)支持。(生物谷Bioon.com)
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